Отчет 51 с., 15 рис., 10 табл, 31 источник - davaiknam.ru o_O
Главная
Поиск по ключевым словам:
страница 1
Похожие работы
Название работы Кол-во страниц Размер
Реферат. Отчет с, 0 ч., рис , табл 1, источников 29, прил Ключевые... 1 33.08kb.
Отчет: 54 с., 3 ч., 20 рис., 1 табл., 19 источников, 1 прил 1 19.26kb.
Отчет 54 с., 6 ч., 19 рис., 1 табл., 73 источн., 0 прил 1 25.97kb.
Отчет 22 с., 4 ч., 9 рис., 1 табл., 11 источников, 0 прил. Ключевые... 1 36.59kb.
Группа Рис 1 Белко Николай Николаевич (рис., русск яз) Скиба Екатерина... 1 33.1kb.
Реферат Бакалаврская работа, 34 с., 17 рис., 6 табл., 15 ист. 3 632.5kb.
Пояснительная записка содержит: 90 стр., 53 рис., 26 табл., 12 источников... 1 63.14kb.
Дипломный проект 135 с., 34 рис., 27 табл., 8 источников. Испытательный... 10 1201.33kb.
Рис. То же, что и на рис. 3, но для истинных магнитуд 1 149.05kb.
Дисциплина: теоретическая механика выполните письменную контрольную... 1 240.64kb.
Формирователь коротких импульсов с применением линий задержки 1 13.39kb.
Вопросы к экзамену по курсу Языки программирования и методы трансляции 1 21.38kb.
Направления изучения представлений о справедливости 1 202.17kb.

Отчет 51 с., 15 рис., 10 табл, 31 источник - страница №1/1

Реферат


Отчет 51 с., 15 рис., 10 табл, 31 источник

Ключевые слова: генетический полиморфизм, биочипы, фармакогенетика, артериальная гипертензия, мутация, медицинская генетика.

Цель работы: разработка и апробация тест-систем на основе биочипов для изучения генетической предрасположенности к развитию наиболее частых мультифакториальных заболеваний (онкологических и сердечно-сосудистых).

Объект исследования: образцы ДНК базы данных Лаборатории пренатальной диагностики ГУ НИИ АГ им.Д.О.Отта РАМН.

Методика: использован метод гибридизации на олигонуклеотидном биочипе

Результаты работы: в настоящее время созданы биочипы для диагностики генетической предрасположенности к онкологическим и сердечно-сосудистым заболеваниям. Биочипы для диагностики генетической предрасположенности к онкологическим заболеваниям является диагностической тест-системой, позволяющей выявлять как генетическую предрасположенность к мультифакториальным заболеваниям (в подавляющем большинстве, онкологическим), так и определять индивидуальную чувствительность к фармацевтическим препаратам. Во многом такая особенность биочипа обусловлена особенностями его конструирования и выбором определенных локусов для анализа. Мы руководствовались следующими принципами при выборе полиморфных локусов: в исследование вошли гены, преимущественно участвующие, как в регулировании метаболизма лекарств, так и в определении генетической предрасположенности к различным мультифакториальным заболеваниям. В этих генах выбирали функционально значимые аллели, встречающиеся с наибольшей частотой. Включали только те гены, полиморфизм которых характерен и уже предварительно изучен в российской популяции. Микрочип устроен по блочному принципу. Каждый блок предназначен для детекции мутаций в группе генов, предрасполагающих к тому или иному заболеванию или имеющих близкие функции. Поэтому, в зависимости от задачи, исследователь может комбинировать блоками при конструировании диагностического биочипа для анализа конкретного заболевания, а также менять число блоков и состав генов внутри блока. Такая особенность осуществима, благодаря универсальности подхода при подборе праймеров и выборе условий проведения мультиплексных ПЦР. В блок №1 входят гены CYP1A1 и CYP2D6. В гене CYP1A1 с помощью чипа можно анализировать мутации С4887А, A4889G и T6235C. Детекция данных мутаций позволяет выявить 4-аллеля этого гена: “дикий тип”, “2A”, “2B” и “4”. В гене CYP2D6 можно выявлять мутации G1934A и DelA2637. Их определение позволяет сделать вывод о наличии у индивидуума аллелей “*4” и “*3”. В блок №2 входят гены GSTT1 и GSTM1. Внутри этих генов с помощью чипа можно анализировать протяженные делеции. Детекция данных мутаций позволяет выявлять так называемые “нулевые” аллели этого гена (гомозигот по делеции), а также определять образцы, в которых есть хотя бы одна копия гена (гетерозиготы по делеции и гомозиготы “дикиго типа. В блок №3 входят гены NAT2 и MTHFR. В гене NAT2 с помощью чипа можно анализировать мутации 481C>T, 590G>A и 857G>A. Детекция данных мутаций позволяет выявить 4-аллеля этого гена: “дикий тип”, “ S1”, “ S2” и “ S3”. В гене MTHFR можно анализировать мутацию С677Т. В блок №4 входят гены CYP2C9 и CYP2C19. В гене CYP2C9 с помощью чипа можно анализировать мутации С430T и C61075T. Детекция данных мутаций позволяет выявить 3-аллеля этого гена: “дикий тип”, “*2” и “ *3”. В гене CYP2C19 можно анализировать мутацию G681A, что позволяет определять “дикий тип” и “*2” аллель этого гена. Таким образом, “Фармаген-биочип” позволяет анализировать 14 мутаций в 8 генах. Кроме того, используя гибридизацию на гелевом микрочипе, мы можем с одинаковой эффективностью определять как однонуклеотидные замены, так и микро и макро делеции (в данном случае используется один раунд мультиплексной ПЦР), а также выявлять близкорасположенные мутации. Микрочип был протестирован на 30 контрольных и более 100 клинических образцах. Результаты тестирования контрольных образцов (идентификация мутаций в них была подтверждена другими методами – ПДРФ, секвенирование и другие) показали полное совпадение. Анализ клинических образцов выявил 2 расхождения из 715 проанализированных мутаций. Таким образом, точность метода составила 99,7%.

Биочип, для анализа генетической предрасположенности к сердечно-сосудистым заболеваниям, устроен аналогично. В блок №1 входят гены REN, AGT, AGTR1, AGTR2. В гене REN с помощью чипа можно анализировать мутацию I9-83G/A, в гене AGT - M235T, в гене AGTR1 - A1166C, в гене AGTR2 - C3123A. В блок №2 входят гены BKR2, ADRB2 и MTHFR. В гене BKR2 с помощью чипа можно анализировать мутацию -T58C, в гене ADRB2 - A48G и C81G, в гене MTHFR - С677Т. Таким образом, “Кардио-биочип” позволяет анализировать 8 мутаций в 7 генах. Микрочип был протестирован на 20 контрольных и более 50 клинических образцах. Результаты тестирования контрольных образцов (идентификация мутаций в них была подтверждена другими методами – ПДРФ, секвенирование и другие) показали полное совпадение. Анализ клинических образцов выявил 1 расхождения из 400 проанализированных мутаций. Таким образом, точность метода составила 99,8%.


Основные конструктивные, технологические и технико-эксплуатационные характеристики: биочип обладает определенной специфичностью и чувствительностью: 1. Специфичность. Биочип должен специфично определять генетические изменения (полиморфизм) в исследуемом образце крови или слюны. В качестве основных параметров выступают характеристики сравнения интенсивности флуоресценции дискриминирующих олигонуклеотидов. 2. Чувствительность. Биочип должен выявлять указанные генетические изменения при наличии не менее 10 000 геном-эквивалентов (молекул ДНК) в 1 мл крови или в 1 мл слюны.

Экономическая эффективность или значимость работы: результатом проекта является создание принципиально новой продукции (материалов, образцов, технологий и др.). Рыночная привлекательность продукта проекта заключается в том, что появляется возможность в кратчайшие, приемлемые для практической медицины, сроки выявлять текущее состояние исследуемых в ходе диагностики образцов и принимать оперативные меры в интересах нейтрализации потенциального негативного воздействия. Наиболее важными достоинствами продукта проекта, в первую очередь интересующих потребителей, является высокая чувствительность диагностики, малые сроки ее проведения, относительная дешевизна, как процесса диагностики, так и используемых оборудования и материалов, простота освоения технологии средним медперсоналом.




Чтобы добиться успеха в этом мире, одной глупости недостаточно — к ней еще нужны хорошие манеры. Приписывается Вольтеру
ещё >>